- 發(fā)展規(guī)劃處作為總體協(xié)調學校發(fā)展改革的行政部門，主要行使政策研究、規(guī)劃管理、“雙一流”與學科建設等職能，下設規(guī)劃與政策研究辦公室、“雙一流”與學科建設辦公室。
- 科學研究科技處網(wǎng)站科技處負責學校科技規(guī)劃與政策制度的制定，科研項目組織申報與管理，科研成果申報、評價與管理，科研基地、科研機構、科研團隊統(tǒng)籌與監(jiān)管，科研信息化建設，科技檔案管理，高水平學術交流平臺搭建，校學術委員會工作的組織協(xié)調，科研誠信宣教與管理，醫(yī)學倫理審查與監(jiān)管等。國家重點實驗室籌備辦公室掛靠科技處，負責國家重點實驗室籌建相關工作。
- 學術期刊期刊中心網(wǎng)站期刊中心所屬有《北京中醫(yī)藥大學學報》《中醫(yī)教育》《現(xiàn)代中醫(yī)臨床》《中醫(yī)科學雜志（英文）》4本期刊，均為教育部主管北京中醫(yī)藥大學主辦的高水平中醫(yī)藥科技刊物。為提高期刊的信息化水平，4本期刊均采用了網(wǎng)上采編系統(tǒng)。期刊采編系統(tǒng)實現(xiàn)了從作者投稿到編輯收稿、外審專家審稿、主編簽發(fā)、作者修稿、編輯加工、發(fā)排出版等全程網(wǎng)絡管理，是科技期刊適應網(wǎng)絡時代的新模式。