2020年12月18日，《中共北京市委宣傳部、中共北京市委教育工作委員會關于印發第二批北京市重點建設馬克思主義學院的通知》（京宣發〔2020〕47號）公布，北京中醫藥大學馬克思主義學院成功入選第二批北京市重點建設馬克思主義學院。
2020年9月，第二批北京市重點建設馬克思主義學院申報和評審工作正式啟動。學校黨委高度重視，第一時間組織材料申報等相關工作。2020年12月10日，北京市重點建設馬克思主義學院專家組一行來我校實地考察。校黨委書記、馬克思主義學院院長谷曉紅作了“奏響新時代思政育人最強音，全力推進馬克思主義學院建設”的專題匯報。
市委教育工委常務副書記鄭吉春對學校高度重視馬克思主義學院建設給予了充分肯定。他指出，一流的大學必須要有一流的馬克思主義學院。他希望北京中醫藥大學馬克思主義學院能通過參加北京市重點建設馬克思主義學院評審，以評促建，多出教育教學與研究成果，不斷提升思政課教育實效。
馬克思主義學院將以成功入選為契機，對標北京市委宣傳部、教育工委的要求，制定具體方案，采取有效措施，在思想政治理論課教育教學、科學研究和馬克思主義理論學科建設等方面進一步努力，不斷提高人才培養質量，不斷鞏固馬克思主義在意識形態領域的指導地位。